You are 4274982 visitor.
Currently 6 users online.


Sequence & secondary structure in dot-bracket notation
       
 PDB id   NDB id  Strands     Number of models     Functional class     Experimental method     Resolution [Å]     PDB deposition
1W2B 1W2B 0, 91RIBOSOMEX-Ray Difraction3.52004-07-01


model 1
>strand_0
UUGGCUACuAUGCCAGCUGGUGGAUUGCUCGGCUCAGGCGCUGAUGAAGGACGUGCCAAGCUGCGAUAAGCCAUGGGGAGCCGCACGGAGGCGAAGAACCAUGGAUUUCCGAAUGAGAAUCUCUCUaACAAUUGCUUCGCGCAAUGAGGAACCCCGAGAACUGAAACAUCUCAGUAUCGGGAGGAACAGAAAACGCAAUGUGAUGUCGUUAGUAACCGCGAGUGAACGCGAUACAGCCCAAACCGAAGCCCUCACGGGCAAUGUGGUGUCAGGGCUACCUCUCAUCAGCCGACCGUCUCGACGAAGUCUCUUGGAACAGAGCGUGAUACAGGGUGACAACCCCGUACUCGAGACCAGUACGACGUGCGGUAGUGCCAGAGUAGCGGGGGUUGGAUAUCCCUCGCGAAUAACGCAGGCAUCGACUGCGAAGGCUAAACACAACCUGAGACCGAUAGUGAACAAGUAGUGUGAACGAACGCUGCAAAGUACCCUCAGAAGGGAGGCGAAAUAGAGCAUGAAAUCAGUUGGCGAUCGAGCGACAGGGCAUACAAGGUCCCUCGACGAAUGACCGACGCGCGAGCGUCCAGUAAGACUCACGGGAAGCCGAUGUUCUGUCGUACGUUUUGAAAAACGAGCCAGGGAGUGUGUCUGCAUGGCAAGUCUAACCGGAGUAUCCGGGGAGGCACAGGGAAACCGACAUGGCCGCAGGGCUUUgCCCGAGGGCCGCCGUCUUCAAGGGCGGGGAGCCAUGUGGACACGACCCGAAUCCGGACGAUCUACGCAUGGACAAGAUGAAGCGUGCCGAAAGGCACGUGGAAGUCUGUUAGAGUUGGUGUCCUACAAUACCCUCUCGUGAUCUAUGUGUAGGGGUGAAAGGCCCAUCGAGUCCGGCAACAGCUGGUUCCAAUCGAAACAUGUCGAAGCAUGACCUCCGCCGAGGUAGUCUGUGAGGUAGAGCGACCGAUUGGUGUGUCCGCCUCCGAGAGGAGUCGGCACAcCUGUCAAACUCCAAACUUACAGACGCCGUUUGACGCGGGGAUUCCGGUGCGCGGGGUAAGCCUGUGUACCAGGAGGGGAACAACCCAGAGAUAGGUUAAGGUCCCCAAGUGUGGAUUAAGUGUAAUCCUCUGAAGGUGGUCUCGAGCCCUAGACAGCCGGGAGGUGAGCUUAGAAGCAGCUACCCUCUAAGAAAAGCGUAACAGCUUACCGGCCGAGGUUUGAGGCGCCCAAAAUGAUCGGGACUCAAAUCCACCACCGAGACCUGUCCGUACCACUCAUACUGGUAAUCGAGUAGAUUGGCGCUCUAAUUGGAUGGAAGUAGGGGUGAAAACUCCUAUGGACCGAUUAGUGACGAAAAUCCUGGCCAUAGUAGCAGCGAUAGUCGGGUGAGAACCCCGACGGCCUAAUGGAUAAGGGUUCCUCAGCACUGCUGAUCAGCUGAGGGUUAGCCGGUCCUAAGUCAUACCGCAACUCGACUAUGACGAAAUGGGAAACGGGUUAAUAUUCCCGUGCCACUAUGCAGUGAAAGUUGACGCCCUGGGGUCGAUCACGCUGGGCAUuCGCCCAGUCGAACCGUCCAACUCCGUGGAAGCCGUAAUGGCAGGAAGCGGACGAACGGCGGCAUAGGGAAACGUGAUUCAACCUGGGGCCCAUGAAAAGACGAGCAUAGUGUCCGUACCGAGAACCGACACAGGUGUCCAUGGCGGCGAAAGCCAAGGCCUGUCGGGAGCAACCAACGUUAGGGAAUUCGGCAAGUUAGUCCCGUACCUUCGGAAGAAGGGAUGCCUGCUCCGGAACGGAGCAGGUCGCAGUGACUCGGAAGCUCGGACUGUCUAGUAACAACAUAGGUGACCGCAAAUCCGCAAGGACUCGUACGGUCACUGAAUCCUGCCCAGUGCAGGUAUCUGAACACCUCGUACAAGAGGACGAAGGACCUGUCAACGGCGGGGGUAACUAUGACCCuCUUAAGGUAGCGUAGUACCUUGCCGCAUCAGUAGCGGCUUGCAUGAAUGGAUUAACCAGAGCUUCACUGUCCCAACGUUGGGCCCGGUGAACUGUACAUUCCAGUGCGGAGUCUGGAGACACCCAGGGGGAAGCGAAGACCCUAUGGAGCUUUACUGCAGGCUGUCGCUGAGACGUGGUCGCCGAUGUGCAGCAUAGGUAGGAGACACUACACAGGUACCCGCGCUAGCGGGCCACCGAGUCAACAGUGAAAUACUACCCGUCGGUGACUGCgACUCUCACUCCGGGAGGAGGACACCGAUAGCCGGGCAGUUUGACUGGGGCGGUACGCGCUCGAAAAGAUAUCGAGCGCGCCCUAUGGCUAUCUCAGCCGGGACAGAgACCCGGCGAAGAGUGCAAGAGCAAAAGAUAGCUUGACAGUGUUCUUCCCAACGAGGAACGCUGACGCGAAAGCGUGGUCUAGCGAACCAAUUAGCCUGCUUGAUGCGGGCAAUUGAUGACAGAAAAGCUACCCUAGGGAUAACAGAGUCGUCACUCGCAAGAGCACAUAUCGACCGAGUGGCUUGCUACCUCGAUGUCGGUUCCCUCCAUCCUGCCCGUGCAGAAGCGGGCAAGGGUGAGGUUGUUCGCCUAUUAAAGGAGGUCGUGAGCUGGGUUUAGACCGUCGUGAGACAGGUCGGCUGCUAUCUACUGGGUGUGUAAUgGUGUCUGACAAGAACGACCGUAUAGUACGAGAGGAACUACGGUUGGUGGCCACUGGUGUACCGGUUGUUCGAGAGAGCACGUGCCGGGUAGCCACGCCACACGGGGUAAGAGCUGAACGCAUCUAAGCUCGAAACCCACUUGGAAAAGAGACACCGCCGAGGUCCCGCGUACAAGACGCGGUCGAUAGACUCGGGGUGUGCGCGUCGAGGUAACGAGACGUUAAGCCCACGAGCACUAACAGACCAAAGCCAUCAU
--------...(((((((((.....(((..((((((((.(((......((((((.[[..[[.)))....(((((((...(((]]..]].)))......)))))).).)))....(((...)))(--.)..(((((.....))))).))...((((((.....(...[..)......))))).).........((.....))...(((((.....((.]...))....)))))...((((...((..(((((....))))....))).....((((((((......(..(.....(((((((....({((((......)))))[[......(((....}]])))....)))))))......)..)...)))))).)).)....(((((((........)))))))......(((((.[[[[[[)))))..)))......)..)))))).))...............((....))....))......(...(((.....))).............)).....)))))))))......(.((((((((((....((((((..((....(....(((((....))))).....)...))..))))..)).)))))))))).<.(((........))).((((((....(((((((((((((..(((...((((.....))))...)))...((....))..(..((((...((((..-))))...)))))(.((((....)))).)...)))))))))))))..((.(...((((((.....((((((((((.((((...(((((((....)))))))...).)))....(((..((.((........)))).)))..).))))))))).(.(((.....)))...)..))))))......).))..((((((....(((((....)))))..((((((...(((.(((((((((...(((.....((..((.----------------------------))..))...)).)...)))))))))))).......)))))).....((((((((((.....))))))))))....(((......)))...(((((((...((([[[...(.((((((.....((...........(((.((((((((((.......(((((.((...(.(.........).)...)).........((......))...)))))...)))))))))))))..........]]]))....))))))))))...)))))))(((((((.......)))))..))....))))))(.(.((((((((......((((((((....))))))))...)))))))).)..).....))))))((.....((.......((((((.......))))))((((....((((..((..(((((((...((.....)).))))))....[[(((.((...((((((.((.....))..)))))).....))...(((((........)))))]]((((((((.......(((...((.(((((...(((((((((((...-{{..)))))(...(((((....(((((....(((.....))).....))))).....)))))....)(....)))))))...))))).))(...)....)))..)))))))).))).))).....((......)).))))..(((.......)))..))))...((((.....((((((((.((..(....(.......(((((....(.[..).....)))))(((((((((.....)))))))))(...).......(((((((((...((.........))...(((((((.....(((....))).......))))))).].(((.(((..(((((((..(((.....((.(......).)).....))))))))..)))))((...------------))........((..........(((((.......)))))..)..)....)))....)).))))))).)..))).)))))))).))))))....)))[[..(((((.....>]])))))..(((((((..(((.((.......(((.((((((..(((((.((((((((..((.----------------------------------------------------------------------------------------------------...))...((((....)))).....))))))))..)))))..(((......[)).)((((((..........]))))))([.(...(((((((.(.((((((-----..))))))...).((][.[[[))....)))))))...(((((((((.........))))))))).(((....))).).]]].].....(((((.(((((.]]]]]]))))))))))....).....))))..)))))........((((.(.((((((...((.......))...))))))...)))).).......(((((.((((((..(((((((((......))))))..)))..((((.....))))......)))))..)...))).))....(((((((....))).))))....))..))).)))))))....--((((((...((((..((((((((.....(....)....))))))))(((((...((((...((((((((((}}..)))))...))))).[.)))).)))))..(((....((((.............))))....))).)))).......)))))).....(((..((((.......)))).....(((..(((((((....(((((..(....)..)))))...))))])))...)))....)))..---------
>strand_9
uUAGGCGGCCACAGCGGUGGGGUUGCCUCCCGUACCCAUCCCGAACACGGAAGAUAAGCCCACCAGCGUUCCGGGGAGUACUGGAGUGCGCGAGCCUCUGGGAAACCCGGUUCGCCGCCACC
...((((((.....(((((((......((((((...(.....)...))))..))....)))))).)....(((((.....((((((.((....))))))))....)))))...))))))...