Search
Structural elements
Secondary structures
Help
About
References
Links
You are
4274989
visitor.
Currently
11
users online.
Supported by:
Institute of Computing Science
,
Poznan University of Technology
Institute of Bioorganic Chemistry
,
Polish Academy of Sciences
Sequence & secondary structure in dot-bracket notation
PDB id
NDB id
Strands
Number of models
Functional class
Experimental method
Resolution [Å]
PDB deposition
2HGP
RR0138
A, 1, C, D, B
1
RIBOSOME
X-Ray Difraction
5.5
2006-06-27
model 1
>strand_A
UUUGUuGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGGUGAACGCUGGCGGCGUGCCUAAGACAUGCAAGUCGUGCGGGCCGCGGGGUUUUACUCCGUGGUCAGCGGCGGACGGGUGAGUAACGCGUGGGUGACCUACCCGGAAGAGGGGGACAACCCGGGGAAACUCGGGCUAAUCCCCCAUGUGGACCCGCCCCUUGGGGUGUGUCCAAAGGGCUUUGCCCGCUUCCGGAUGGGCCCGCGUCCCAUCAGCUAGUUGGUGGGGUAAUGGCCCACCAAGGCGACGACGGGUAGCCGGUCUGAGAGGAUGGCCGGCCACAGGGGCACUGAGACACGGGCCCCACUCCUACGGGAGGCAGCAGUUAGGAAUCUUCCGCAAUGGGCGCAAGCCUGACGGAGCGACGCCGCUUGGAGGAAGAAGCCCUUCGGGGUGUAAACUCCUGAACCCGGGACGAAACCCCCGACGAGGGGACUGACGGUACCGGGGUAAUAGCGCCGGCCAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGAGGGCGCGAGCGUUACCCGGAUUCACUGGGCGUAAAGGGCGUGUAGGCGGCCUGGGGCGUCCCAUGUGAAAGACCACGGCUCAACCGUGGGGGAGCGUGGGAUACGCUCAGGCUAGACGGUGGGAGAGGGUGGUGGAAUUCCCGGAGUAGCGGUGAAAUGCGCAGAUACCGGGAGGAACGCCGAUGGCGAAGGCAGCCACCUGGUCCACCCGUGACGCUGAGGCGCGAAAGCGUGGGGAGCAAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCACGCCCUAAACGAUGCGCGCUAGGUCUCUGGGUCUCCUGGGGGCCGAAGCUAACGCGUUAAGCGCGCCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGCUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAAGCAACGCGAAGAACCUUACCAGGCCUUGACAUGCUAGGGAACCCGGGUGAAAGCCUGGGGUGCCCCGCGAGGGGAGCCCUAGCACAGGUGCUGCAUGGCCGUCGUCAGCUCGUGCCGUGAGGUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGCCGUUAGUUGCCAGCGGUUCGGCCGGGCACUCUAACGGGACUGCCCGCGAAAGCGGGAGGAAGGAGGGGACGACGUCUGGUCAGCAUGGCCCUUACGGCCUGGGCGACACACGUGCUACAAUGCCCACUACAAAGCGAUGCCACCCGGCAACGGGGAGCUAAUCGCAAAAAGGUGGGCCCAGUUCGGAUUGGGGUCUGCAACCCGACCCCAUGAAGCCGGAAUCGCUAGUAAUCGCGGAUCAGCCAUGCCGCGGUGAAUACGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACGCCAUGGGAGCGGGCUCUACCCGAAGUCGCCGGGAGCCUACGGGCAGGCGCCGAGGGUAGGGCCCGUGACUGGGGCGAAGUCGUAACAAGGUAGCUGUACCGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUUCU
-----....(((((.[.[[[.))))).((((.(((((..(((((((((....(((.(((..(((..((.(((((((((.......))))))))).)))))......(((......((((((((..((...(((((((.(((((....((((((....)))))).....)))))....((((.(((((....))))).))))...((((...)))).)))))))..))))))))))(((....(((..((((((((.......)))))))))))......)))..((((((((....))))...))))))).(((((............))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....)))).))))).)).))))))..((((......((((....)))).....))))....(((((...(.....(((.....)))......)....)))))......((((([[[...(((((.....((.]]])).......))))))))))..)))))))))..........(((.......((((...(((.(((((((.((((((((((......((((((.....))))))....))))))))..)))))))))..(((((((((...((((((((...(((((((....(.(......).).......)))))))...).......((....)).)))))))..))))).)))..))))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........((((((..((((((((((...))))))))))...((....)).....)))))).))).(((......((((....))))....)))...]]].](((((.(((((((.((..(((((..((((((((((......((........))..........(((((((......((((((((..(((((((....))))))).(.((((....)))).)))))))))..((.(((...((((((.((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((.(..(.(..(((.....)))).)...).))))).....(((((....)))))........))))....)).).)))...)).)))))....)))))))...)).)))))))).(...(((((((.....(((..((..((((....))))..))....))).....)))))))......(....(((((((........)))))))....)..)..))))).....(((((((..........)))))))......))...)))))))))).))....(..((...((((.(((..((((((((((((....(.((((....(((....))).)))).)...))))))))))))..))).))))....))...).....(((((((((....)))))))))..(..((((((((.--
>strand_1
UUUUUUUUUUUUUUUUUGGCAAGGAGGUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUU
....................))))))))..)...[..[[[{{{.......
>strand_C
GCCCGGAUAGCUCAGUCGGUAGAGCAGGGGAUUGAAAAUCCCCGUGUCCUUGGUUCGAUUCCGAGUCCGGGCACCA
(((((((..((((........)))).(((((..]]]..))))).....(((((.......))))))))))))....
>strand_D
GCCCGGAUAGCUCAGUCGGUAGAGCAGGGGAUUGAAAAUCCCCGUGUCCUUGGUUCGAUUCCGAGUCCGGGCACCA
(((((((..((((........)))).((((((...].)))))).....(((((.......))))))))))))....
>strand_B
GCCCGGAUAGCUCAGUCGGUAGAGCAGGGGAUUGAAAAUCCCCGUGUCCUUGGUUCGAUUCCGAGUCCGGGCACCA
(((((((..(..(........)..).(((((..}}}..))))).....(((((.......))))))))))))....