You are 4274977 visitor.
Currently 6 users online.


Sequence & secondary structure in dot-bracket notation
       
 PDB id   NDB id  Strands     Number of models     Functional class     Experimental method     Resolution [Å]     PDB deposition
2LKR 2LKR A10RNANMR2011-10-19


models:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10

 model 1 
>strand_A
gGCAAUACAGAGAUGAUCAGCAGUUCCCCUGCAUAAGGAUGAACCGUUUUACAAAGAGAUUUCUUCGGGAAUCUCUUUGCCUUUUGGCUUAGAUCAAGUGUAGUAUCUGUC
((...((.......(((((((..(((.(((.....)))..)))........((((((((((((....)))))))))))).......)))..))))........))....))
 model 2 
>strand_A
gGCAAUACAGAGAUGAUCAGCAGUUCCCCUGCAUAAGGAUGAACCGUUUUACAAAGAGAUUUCUUCGGGAAUCUCUUUGCCUUUUGGCUUAGAUCAAGUGUAGUAUCUGUC
.(((.(.(.....(.(((((..((((..((.....))...)))).......(((..(((((((....)))))))..)))........))..))).)......).)..))).
 model 3 
>strand_A
gGCAAUACAGAGAUGAUCAGCAGUUCCCCUGCAUAAGGAUGAACCGUUUUACAAAGAGAUUUCUUCGGGAAUCUCUUUGCCUUUUGGCUUAGAUCAAGUGUAGUAUCUGUC
((...(((.....((((((((..(((.(((.....)))..))).........(((((((((((....)))))))))))........)))..)))))......)))....))
 model 4 
>strand_A
gGCAAUACAGAGAUGAUCAGCAGUUCCCCUGCAUAAGGAUGAACCGUUUUACAAAGAGAUUUCUUCGGGAAUCUCUUUGCCUUUUGGCUUAGAUCAAGUGUAGUAUCUGUC
((...((.......((((((..((((.(((.....)))..)))).......((((((((((((....))))))))))))........))..))))........))....))
 model 5 
>strand_A
gGCAAUACAGAGAUGAUCAGCAGUUCCCCUGCAUAAGGAUGAACCGUUUUACAAAGAGAUUUCUUCGGGAAUCUCUUUGCCUUUUGGCUUAGAUCAAGUGUAGUAUCUGUC
((.(((((......(((((((..(((.(((.....)))..)))........((((((((((((....)))))))))))).......)))..)))).......)))).).))
 model 6 
>strand_A
gGCAAUACAGAGAUGAUCAGCAGUUCCCCUGCAUAAGGAUGAACCGUUUUACAAAGAGAUUUCUUCGGGAAUCUCUUUGCCUUUUGGCUUAGAUCAAGUGUAGUAUCUGUC
((..((((......(((((((..(((.(((.....)))..)))........((((((((((((....)))))))))))).......)))..)))).......))))...))
 model 7 
>strand_A
gGCAAUACAGAGAUGAUCAGCAGUUCCCCUGCAUAAGGAUGAACCGUUUUACAAAGAGAUUUCUUCGGGAAUCUCUUUGCCUUUUGGCUUAGAUCAAGUGUAGUAUCUGUC
((..((.......(((((((...(((.(((.....)))..)))........((((((((((((....))))))))))))........))..)))))........))...))
 model 8 
>strand_A
gGCAAUACAGAGAUGAUCAGCAGUUCCCCUGCAUAAGGAUGAACCGUUUUACAAAGAGAUUUCUUCGGGAAUCUCUUUGCCUUUUGGCUUAGAUCAAGUGUAGUAUCUGUC
((...((......(((((((..((((.(((.....)))..)))).......((((((((((((....))))))))))))........))..))))).......))....))
 model 9 
>strand_A
gGCAAUACAGAGAUGAUCAGCAGUUCCCCUGCAUAAGGAUGAACCGUUUUACAAAGAGAUUUCUUCGGGAAUCUCUUUGCCUUUUGGCUUAGAUCAAGUGUAGUAUCUGUC
((...(((.....((((((((..(((.(((.....)))..)))........((((((((((((....)))))))))))).......)))..)))))......)))....))
 model 10 
>strand_A
gGCAAUACAGAGAUGAUCAGCAGUUCCCCUGCAUAAGGAUGAACCGUUUUACAAAGAGAUUUCUUCGGGAAUCUCUUUGCCUUUUGGCUUAGAUCAAGUGUAGUAUCUGUC
.(((.((......(((((.(..((((.(.(.....).)..)))).......(((..(((((((....)))))))..)))........)...))))).......))..))).