You are 4028717 visitor.
Currently 6 users online.


Sequence & secondary structure in dot-bracket notation
       
 PDB id   NDB id  Strands     Number of models     Functional class     Experimental method     Resolution [Å]     PDB deposition
2WWQ 2WWQ A, B, V, X1RIBOSOMEElectron Microscopy5.82009-10-26


model 1
>strand_A
gCCUGGCGGCCGUAGCGCGGUGGUCCCACCUGACCCCAUGCCGAACUCAGAAGUGAAACGCCGUAGCGCCGAUGGUAGUGUGGGGUCUCCCCAUGCGAGAGUAGGGAACUGCCAGGC
(-((-((((.....((((((((....(((((((...(.....)...))))..)))...)))))).)).((.......((((((((...)))))))).......))...)))).)).)
>strand_B
GGUUAAGCGACUAAGCGUACACGGUGGAUGCCCUGGCAGUCAGAGGCGAUGAAGGACGUGCUAAUCUGCGAUAAGCGUCGGUAAGGUGAUAUGAACCGUUAUAACCGGCGAUUUCCGAAUGGGGAAACCCAGUGUGUUUCGACACACUAUCAUUAACUGAAUCCAUAGGUUAAUGAGGCGAACCGGGGGAACUGAAACAUCUAAGUACCCCGAGGAAAAGAAAUCAACCGAGAUUCCCCCAGUAGCGGCGAGCGAACGGGGAGCAGCCCAGAGCCUGAAUCAGUGUGUGUGUUAGUGGAAGCGUCUGGAAAGGCGCGCGAUACAGGGUGACAGCCCCGUACACAAAAAUGCACAUGCUGUGAGCUCGAUGAGUAGGGCGGGACACGUGGUAUCCUGUCUGAAUAUGGGGGGACCAUCCUCCAAGGCUAAAUACUCCUGACUGACCGAUAGUGAACCAGUACCGUGAGGGAAAGGCGAAAAGAACCCCGGCGAGGGGAGUGAAAAAGAACCUGAAACCGUGUACGUACAAGCAGUGGGAGCACGCUUAGGCGUGUGACUGCGUACCUUUUGUAUAAUGGGUCAGCGACUUAUAUUCUGUAGCAAGGUUAACCGAAUAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGUCUUAACUGGGCGUUAAGUUGCAGGGUAUAGACCCGAAACCCGGUGAUCUAGCCAUGGGCAGGUUGAAGGUUGGGUAACACUAACUGGAGGACCGAACCGACUAAUGUUGAAAAAUUAGCGGAUGACUUGUGGCUGGGGGUGAAAGGCCAAUCAAACCGGGAGAUAGCUGGUUCUCCCCGAAAGCUAUUUAGGUAGCGCCUCGUGAAUUCAUCUCCGGGGGUAGAGCACUGUUUCGGCAAGGGGGUCAUCCCGACUUACCAACCCGAUGCAAACUGCGAAUACCGGAGAAUGUUAUCACGGGAGACACACGGCGGGUGCUAACGUCCGUCGUGAAGAGGGAAACAACCCAGACCGCCAGCUAAGGUCCCAAAGUCAUGGUUAAGUGGGAAACGAUGUGGGAAGGCCCAGACAGCCAGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAAAGCGUAAUAGCUCACUGGUCGAGUCGGCCUGCGCGGAAGAUGUAACGGGGCUAAACCAUGCACCGAAGCUGCGGCAGCGACGCUUAUGCGUUGUUGGGUAGGGGAGCGUUCUGUAAGCCUGCGAAGGUGUGCUGUGAGGCAUGCUGGAGGUAUCAGAAGUGCGAAUGCUGACAUAAGUAACGAUAAAGCGGGUGAAAAGCCCGCUCGCCGGAAGACCAAGGGUUCCUGUCCAACGUUAAUCGGGGCAGGGUGAGUCGACCCCUAAGGCGAGGCCGAAAGGCGUAGUCGAUGGGAAACAGGUUAAUAUUCCUGUACUUGGUGUUACUGCGAAGGGGGGACGGAGAAGGCUAUGUUGGCCGGGCGACGGUUGUCCCGGUUUAAGCGUGUAGGCUGGUUUUCCAGGCAAAUCCGGAAAAUCAAGGCUGAGGCGUGAUGACGAGGCACUACGGUGCUGAAGCAACAAAUGCCCUGCUUCCAGGAAAAGCCUCUAAGCAUCAGGUAACAUCAAAUCGUACCCCAAACCGACACAGGUGGUCAGGUAGAGAAUACCAAGGCGCUUGAGAGAACUCGGGUGAAGGAACUAGGCAAAAUGGUGCCGUAACUUCGGGAGAAGGCACGCUGAUAUGUAGGUGAGGUCCCUCGCGGAUGGAGCUGAAAUCAGUCGAAGAUACCAGCUGGCUGCAACUGUUUAUUAAAAACACAGCACUGUGCAAACACGAAAGUGGACGUAUACGGUGUGACGCCUGCCCGGUGCCGGAAGGUUAAUUGAUGGGGUUAGCGCAAGCGAAGCUCUUGAUCGAAGCCCCGGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAUGGCGUAAUGAUGGCCAGGCUGUCUCCACCCGAGACUCAGUGAAAUUGAACUCGCUGUGAAGAUGCAGUGUACCCGCGGCAAGACGGAAAGACCCCGUGAACCUUUACUAUAGCUUGACACUGAACAUUGAGCCUUGAUGUGUAGGAUAGGUGGGAGGCUUUGAAGUGUGGACGCCAGUCUGCAUGGAGCCGACCUUGAAAUACCACCCUUUAAUGUUUGAUGUUCUAACGUUGACCCGUAAUCCGGGUUGCGGACAGUGUCUGGUGGGUAGUUUGACUGGGGCGGUCUCCUCCUAAAGAGUAACGGAGGAGCACGAAGGUUGGCUAAUCCUGGUCGGACAUCAGGAGGUUAGUGCAAUGGCAUAAGCCAGCUUGACUGCGAGCGUGACGGCGCGAGCAGGUGCGAAAGCAGGUCAUAGUGAUCCGGUGGUUCUGAAUGGAAGGGCCAUCGCUCAACGGAUAAAAGGUACUCCGGGGAUAACAGGCUGAUACCGCCCAAGAGUUCAUAUCGACGGCGGUGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCACAUCCUGGGGCUGAAGUAGGUCCCAAGGGUAUGGCUGUUCGCCAUUUAAAGUGGUACGCGAGCUGGGUUUAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCUGCCGUGGGCGCUGGAGAACUGAGGGGGGCUGCUCCUAGUACGAGAGGACCGGAGUGGACGCAUCACUGGUGUUCGGGUUGUCAUGCCAAUGGCACUGCCCGGUAGCUAAAUGCGGAAGAGAUAAGUGCUGAAAGCAUCUAAGCACGAAACUUGCCCCGAGAUGAGUUCUCCCUGACCCUUUAAGGGUCCUGAAGGAACGUUGAAGACGACGACGUUGAUAGGCCGGGUGUGUAAGCGCAGCGAUGCGUUGAGCUAACCGGUACUAAUGAACCGUGAGGCUUAACCU
((((((((......((((((((((.....(((..(((((((((((((......((((((.[..[[[.))).....((((((...(((]]]..].))).......))))))...)))....(((....)))(((((((....))))))).(((((((((.........))))))))).))...((((((.....(...[..)......))))).).........((....))...(((((.....((.]...))....)))))...((((.((((......(((((((((((((.(((...(((((......)))))[[(...).(((.....]])))...)))...)))))))))))))...))))...)....((((..((..[......))..))))......(((((].[[[[)))))..)))......)).))))))).))...............((....))....))......(..((((.....))))............)).....)))))))))).....(.((((..(((((......)))))..)))).[.(.(........).).((((((....(((((((((((((..(((...((.....))...)))...((....))..((((.....)))).....)))))))))))))..((.(...((((((.....((((((((((.((((...((((((......))))))...)[)))...(((.(((((........))))))))..).))))))))).(.(((.....)))...)..))))))......).))..((((((....(((((....))))).((((((((...(((((((((.(...(((...(((.((((...(.(((((.....)))))..)...)))).)))..)).)...).)))))).)))...))))))).)...((((((((((......))))))))))....(((......)))...((((.(((...((([[[...(.((((((.....(.....((..(((((..(((.......(.(((.(((..(((.........)))..))).....(..(((......)))).))).)...)))..))))).))...........]]].)...))))))))))...)))))))(((((((((....)))))))))....))))))(.(((((...(((......((((((((....))))))))...)))..)))))..).....))))))(......((.....((((((.......))))))((((....((((..((..(((((((...((.....)).))))))....[[(((..((...(((...(((....)))...)))...))...(((((........)))))]](((((((((((((...((((....((((..(((..((((((((((.....{{{....)))))((..((((...((((((((((((.((.....))))))))))..))))..[))))...))(..(((((....)))))...))))))...)))...))))(..).....))))...))....))))))))))).))).))).....((......)).)))).((((.....))))..))))..((((....((((((((.((..(....(.......(((((....(.{..).....)))))((((((.....(((...(((((..)]))))...)))...))))))(...).......(((((((((.].((.........))...(((((((.....(((....))).......))))))).}((((.(((..(((((((..((.........(((((..((....))...))))).........)))))))..)))))(((((.........)))))........((..........((((((.....))))))..)..)....))))...)).))))))).)..))).)))))))).)))))).....)).{..(((((.....]}.)))))..((((((((.(((.((......((((.((((((..(((((.(((.(((((.(((((((((((.((((.(......[....((............((..(.((....)).)..))................]..))..).)))).)))))))))))...(((.((((((.....)))))))))....))))).)))..)))))..(((..<<..[)))(((((...........].)))))([((...(((((((.(.(((((.........)))))...).((][.[[[))....)))))))...((((..((((..{.))))..)))).(((....))).))]]].].....(((((((.((..]]]]..))))))))).....)}......))))..))))))......(((((.((((((((...((.......))...)))))))..)))).).).....((((..((((((..(((((((((......))))))..))).(((((.....))))).....)))))..)....)).))....(((((((....))).))))....))..)))))))))))[...(((((((...((((..(((((((.....(....)....))))))).(((((...((((...(((((((((((}}}.))))))..)))))...)))).)))))...(((....((((.............))))....))).))))..]....)))))))(.((((((...))))))(....((..(((((.......)))))....((((((((..((....(((((....)))))...))...))))).))).....))..).))))))))).
>strand_V
CGGCACGUAGCGCAGCCUGGUAGCGCACCGUCAUGGGGUGUCGGGGGUCGGAGGuUCAAAUCCUCUCGUGCCGACCA
(((((((..((((.........)))).(((.(..[[[..).))).....((.((.......)).))))))))).>>.
>strand_X
AAAACCCAGUA
....]]]....