You are 4275287 visitor.
Currently 11 users online.


Sequence & secondary structure in dot-bracket notation
       
 PDB id   NDB id  Strands     Number of models     Functional class     Experimental method     Resolution [Å]     PDB deposition
2QAO RR0172 A, B1RIBOSOMEX-Ray Difraction3.212007-06-15


model 1
>strand_A
UgCCUGGCGGCCGUAGCGCGGUGGUCCCACCUGACCCCAUGCCGAACUCAGAAGUGAAACGCCGUAGCGCCGAUGGUAGUGUGGGGUCUCCCCAUGCGAGAGUAGGGAACUGCCAGGCAU
-(((((((((.....((((((((.....((((((...(.....)...))))..))....)))))).)).((.......((((((((...)))))))).......))...)))))))))--
>strand_B
GGUUAAGCGACUAAGCGUACACGGUGGAUGCCCUGGCAGUCAGAGGCGAUGAAGGACGUGCUAAUCUGCGAUAAGCGUCGGUAAGGUGAUAUGAACCGUUAUAACCGGCGAUUUCCGAAUGGGGAAACCCAGUGUGUUUCGACACACUAUCAUUAACUGAAUCCAUAGGUUAAUGAGGCGAACCGGGGGAACUGAAACAUCUAAGUACCCCGAGGAAAAGAAAUCAACCGAGAUUCCCCCAGUAGCGGCGAGCGAACGGGGAGCAGCCCAGAGCCUGAAUCAGUGUGUGUGUUAGUGGAAGCGUCUGGAAAGGCGCGCGAUACAGGGUGACAGCCCCGUACACAAAAAUGCACAUGCUGUGAGCUCGAUGAGUAGGGCGGGACACGUGGUAUCCUGUCUGAAUAUGGGGGGACCAUCCUCCAAGGCUAAAUACUCCUGACUGACCGAUAGUGAACCAGUACCGUGAGGGAAAGGCGAAAAGAACCCCGGCGAGGGGAGUGAAAAAGAACCUGAAACCGUGUACGUACAAGCAGUGGGAGCACGCUUAGGCGUGUGACUGCGUACCUUUUGUAUAAUGGGUCAGCGACUUAUAUUCUGUAGCAAGGUUAACCGAAUAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGUCUUAACUGGGCGUUAAGUUGCAGGGUAUAGACCCGAAACCCGGUGAUCUAGCCAUGGGCAGGUUGAAGGUUGGGUAACACUAACUGGAGGACCGAACCGACUAAUGUUGAAAAAUUAGCGGAUGACUUGUGGCUGGGGGUGAAAGGCCAAUCAAACCGGGAGAUAGCUGGUUCUCCCCGAAAGCUAUUUAGGUAGCGCCUCGUGAAUUCAUCUCCGGGGGUAGAGCACUGUUUCGGCAAGGGGGUCAUCCCGACUUACCAACCCGAUGCAAACUGCGAAUACCGGAGAAUGUUAUCACGGGAGACACACGGCGGGUGCUAACGUCCGUCGUGAAGAGGGAAACAACCCAGACCGCCAGCUAAGGUCCCAAAGUCAUGGUUAAGUGGGAAACGAUGUGGGAAGGCCCAGACAGCCAGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAAAGCGUAAUAGCUCACUGGUCGAGUCGGCCUGCGCGGAAGAUGUAACGGGGCUAAACCAUGCACCGAAGCUGCGGCAGCGACGCUUAUGCGUUGUUGGGUAGGGGAGCGUUCUGUAAGCCUGCGAAGGUGUGCUGUGAGGCAUGCUGGAGGUAUCAGAAGUGCGAAUGCUGACAUAAGUAACGAUAAAGCGGGUGAAAAGCCCGCUCGCCGGAAGACCAAGGGUUCCUGUCCAACGUUAAUCGGGGCAGGGUGAGUCGACCCCUAAGGCGAGGCCGAAAGGCGUAGUCGAUGGGAAACAGGUUAAUAUUCCUGUACUUGGUGUUACUGCGAAGGGGGGACGGAGAAGGCUAUGUUGGCCGGGCGACGGUUGUCCCGGUUUAAGCGUGUAGGCUGGUUUUCCAGGCAAAUCCGGAAAAUCAAGGCUGAGGCGUGAUGACGAGGCACUACGGUGCUGAAGCAACAAAUGCCCUGCUUCCAGGAAAAGCCUCUAAGCAUCAGGUAACAUCAAAUCGUACCCCAAACCGACACAGGUGGUCAGGUAGAGAAUACCAAGGCGCUUGAGAGAACUCGGGUGAAGGAACUAGGCAAAAUGGUGCCGUAACUUCGGGAGAAGGCACGCUGAUAUGUAGGUGAGGUCCCUCGCGGAUGGAGCUGAAAUCAGUCGAAGAUACCAGCUGGCUGCAACUGUUUAUUAAAAACACAGCACUGUGCAAACACGAAAGUGGACGUAUACGGUGUGACGCCUGCCCGGUGCCGGAAGGUUAAUUGAUGGGGUUAGCGCAAGCGAAGCUCUUGAUCGAAGCCCCGGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAUGGCGUAAUGAUGGCCAGGCUGUCUCCACCCGAGACUCAGUGAAAUUGAACUCGCUGUGAAGAUGCAGUGUACCCGCGGCAAGACGGAAAGACCCCGUGAACCUUUACUAUAGCUUGACACUGAACAUUGAGCCUUGAUGUGUAGGAUAGGUGGGAGGCUUUGAAGUGUGGACGCCAGUCUGCAUGGAGCCGACCUUGAAAUACCACCCUUUAAUGUUUGAUGUUCUAACGUUGACCCGUAAUCCGGGUUGCGGACAGUGUCUGGUGGGUAGUUUGACUGGGGCGGUCUCCUCCUAAAGAGUAACGGAGGAGCACGAAGGUUGGCUAAUCCUGGUCGGACAUCAGGAGGUUAGUGCAAUGGCAUAAGCCAGCUUGACUGCGAGCGUGACGGCGCGAGCAGGUGCGAAAGCAGGUCAUAGUGAUCCGGUGGUUCUGAAUGGAAGGGCCAUCGCUCAACGGAUAAAAGGUACUCCGGGGAUAACAGGCUGAUACCGCCCAAGAGUUCAUAUCGACGGCGGUGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCACAUCCUGGGGCUGAAGUAGGUCCCAAGGGUAUGGCUGUUCGCCAUUUAAAGUGGUACGCGAGCUGGGUUUAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCUGCCGUGGGCGCUGGAGAACUGAGGGGGGCUGCUCCUAGUACGAGAGGACCGGAGUGGACGCAUCACUGGUGUUCGGGUUGUCAUGCCAAUGGCACUGCCCGGUAGCUAAAUGCGGAAGAGAUAAGUGCUGAAAGCAUCUAAGCACGAAACUUGCCCCGAGAUGAGUUCUCCCUGACCCUUUAAGGGUCCUGAAGGAACGUUGAAGACGACGACGUUGAUAGGCCGGGUGUGUAAGCGCAGCGAUGCGUUGAGCUAACCGGUACUAAUGAACCGUGAGGCUUAACCUU
((((((((......((((((((((.....(((..(((((((((((((......((((((.[..[[[.)))....(((((((...(((]]]..].))).......)))))).).)))....(((....)))(((((((....))))))).(((((((((.........))))))))).))...((((((.....(...[..)......))))).).........((....))...(((((.....((.]...))....)))))...((((.((((......(((((((((((((.(((...(((((......)))))[[(...).(((.....]])))...)))...)))))))))))))...))))...)....((((((((..[......))))))))......(((((].[[[[)))))..)))......)).))))))).))...............((....))....))......(..((((.....))))............)).....)))))))))).....(.((((..(((((......)))))..)))).[.(.(........).).((((((....(((((((((((((..(((...((.....))...)))...((....))..((((.....)))).....)))))))))))))..((.(...((((((.....((((((((((.((((...((((((......))))))...)[)))...(((.(((((........))))))))..).))))))))).(.(((.....)))...)..))))))......).))..((((((....(((((....))))).((((((((...(((((((((.(...(((...(((.((((...-------------------....)))).)))..)).)...).)))))).)))...))))))).)...((((((((((......))))))))))....(((......)))...((((.(((...((([[[...(.((((((.....(.....((..(((((..(((.....{.(((((.(((..(((.........)))..))).....(..(((......)))).)))))...)))..))))).))...........]]].)...))))))))))...)))))))(((((((((....)))))))))....))))))(.(((((...(((......((((((((....))))))))...)))..)))))..).....))))))(......((.....((((((.......))))))((((....((((..((..(((((((...((.....)).))))))....[[(((..((...(((...(((....)))...)))...))...(((((........)))))]](((((((((((((...((((....((((..(((..((((((((((.....{{{....)))))((..((((...((((((((((((.((.....))))))))))..))))..[))))...))(..(((((....)))))...))))))...)))...))))(..).....))))...))....))))))))))).))).))).....((......)).)))).((((.....))))..))))..((((....((((((((.((..(....(.......(((((....(.{..).....)))))((((((.....(((...(((((..)]))))...)))...))))))(...).......(((((((((.].((.........))...(((((((.....(((....))).......))))))).}((((.(((..(((((((..(((........(((((..((....))...)))))........))))))))..)))))(((((.........)))))........((..........((((((.....))))))..)..)....))))...)).))))))).)..))).)))))))).)))))).....)).{..(((((.....]}.)))))..((((((((.(((.((......((((.((((((..(((((.(((.(((((.(((((((((((.((((.(----------------------...(((((((......)))))))..---------------------).)))).)))))))))))...(((.((((((.....)))))))))....))))).)))..)))))..(((......[)))((((((..(....)..]))))))([((...(((((((.(.((((((.......))))))...).((][.[[[))....)))))))...((((..((((..{.))))..)))).(((....))).))]]].].....(((((((.((..]]]]..))))))))).....)}......))))..))))))......(((((.(.((((((...((.......))...))))))...)))).).).....(((((.((((((..(((((((((......))))))..))).(((((.....))))).....)))))..)...))).))....(((((((....))).))))....))..)))))))))))[...(((((((...((((..((((((......(....).....)))))).(((((...((((...(((((((((((}}}.))))))..)))))...)))).)))))...(((....((((.....}.......))))....))).))))..]....)))))))(.((((((...))))))(....((..(((((.......)))))....((((((((..((....(((((....)))))...))...))))).))).....))..).))))))))).-