You are 4035073 visitor.
Currently 10 users online.


Sequence & secondary structure in dot-bracket notation
       
 PDB id   NDB id  Strands     Number of models     Functional class     Experimental method     Resolution [Å]     PDB deposition
3I20 NA0082 A, B1RIBOSOMEX-Ray Difraction3.712009-06-28

model 1
>strand_A
gGUUAAGCGACUAAGCGUACACGGUGGAUGCCCUGGCAGUCAGAGGCGAUGAAGGACGUGCUAAUCUGCGAUAAGCGUCGGUAAGGUGAUAUGAACCGUUAUAACCGGCGAUUUCCGAAUGGGGAAACCCAGUGUGUUUCGACACACUAUCAUUAACUGAAUCCAUAGGUUAAUGAGGCGAACCGGGGGAACUGAAACAUCUAAGUACCCCGAGGAAAAGAAAUCAACCGAGAUUCCCCCAGUAGCGGCGAGCGAACGGGGAGCAGCCCAGAGCCUGAAUCAGUGUGUGUGUUAGUGGAAGCGUCUGGAAAGGCGCGCGAUACAGGGUGACAGCCCCGUACACAAAAAUGCACAUGCUGUGAGCUCGAUGAGUAGGGCGGGACACGUGGUAUCCUGUCUGAAUAUGGGGGGACCAUCCUCCAAGGCUAAAUACUCCUGACUGACCGAUAGUGAACCAGUACCGUGAGGGAAAGGCGAAAAGAACCCCGGCGAGGGGAGUGAAAAAGAACCUGAAACCGUGUACGUACAAGCAGUGGGAGCACGCUUAGGCGUGUGACUGCGUACCUUUUGUAUAAUGGGUCAGCGACUUAUAUUCUGUAGCAAGGUUAACCGAAUAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGUCUUAACUGGGCGUUAAGUUGCAGGGUAUAGACCCGAAACCCGGUGAUCUAGCCAUGGGCAGGUUGAAGGUUGGGUAACACUAACUGGAGGACCGAACCGACUAAUGUUGAAAAAUUAGCGGAUGACUUGUGGCUGGGGGUGAAAGGCCAAUCAAACCGGGAGAUAGCUGGUUCUCCCCGAAAGCUAUUUAGGUAGCGCCUCGUGAAUUCAUCUCCGGGGGUAGAGCACUGUUUCGGCAAGGGGGUCAUCCCGACUUACCAACCCGAUGCAAACUGCGAAUACCGGAGAAUGUUAUCACGGGAGACACACGGCGGGUGCUAACGUCCGUCGUGAAGAGGGAAACAACCCAGACCGCCAGCUAAGGUCCCAAAGUCAUGGUUAAGUGGGAAACGAUGUGGGAAGGCCCAGACAGCCAGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAAAGCGUAAUAGCUCACUGGUCGAGUCGGCCUGCGCGGAAGAUGUAACGGGGCUAAACCAUGCACCGAAGCUGCGGCAGCGACGCUUAUGCGUUGUUGGGUAGGGGAGCGUUCUGUAAGCCUGCGAAGGUGUGCUGUGAGGCAUGCUGGAGGUAUCAGAAGUGCGAAUGCUGACAUAAGUAACGAUAAAGCGGGUGAAAAGCCCGCUCGCCGGAAGACCAAGGGUUCCUGUCCAACGUUAAUCGGGGCAGGGUGAGUCGACCCCUAAGGCGAGGCCGAAAGGCGUAGUCGAUGGGAAACAGGUUAAUAUUCCUGUACUUGGUGUUACUGCGAAGGGGGGACGGAGAAGGCUAUGUUGGCCGGGCGACGGUUGUCCCGGUUUAAGCGUGUAGGCUGGUUUUCCAGGCAAAUCCGGAAAAUCAAGGCUGAGGCGUGAUGACGAGGCACUACGGUGCUGAAGCAACAAAUGCCCUGCUUCCAGGAAAAGCCUCUAAGCAUCAGGUAACAUCAAAUCGUACCCCAAACCGACACAGGUGGUCAGGUAGAGAAUACCAAGGCGCUUGAGAGAACUCGGGUGAAGGAACUAGGCAAAAUGGUGCCGUAACUUCGGGAGAAGGCACGCUGAUAUGUAGGUGAGGUCCCUCGCGGAUGGAGCUGAAAUCAGUCGAAGAUACCAGCUGGCUGCAACUGUUUAUUAAAAACACAGCACUGUGCAAACACGAAAGUGGACGUAUACGGUGUGACGCCUGCCCGGUGCCGGAAGGUUAAUUGAUGGGGUUAGCGCAAGCGAAGCUCUUGAUCGAAGCCCCGGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAUGGCGUAAUGAUGGCCAGGCUGUCUCCACCCGAGACUCAGUGAAAUUGAACUCGCUGUGAAGAUGCAGUGUACCCGCGGCAAGACGGAAAGACCCCGUGAACCUUUACUAUAGCUUGACACUGAACAUUGAGCCUUGAUGUGUAGGAUAGGUGGGAGGCUUUGAAGUGUGGACGCCAGUCUGCAUGGAGCCGACCUUGAAAUACCACCCUUUAAUGUUUGAUGUUCUAACGUUGACCCGUAAUCCGGGUUGCGGACAGUGUCUGGUGGGUAGUUUGACUGGGGCGGUCUCCUCCUAAAGAGUAACGGAGGAGCACGAAGGUUGGCUAAUCCUGGUCGGACAUCAGGAGGUUAGUGCAAUGGCAUAAGCCAGCUUGACUGCGAGCGUGACGGCGCGAGCAGGUGCGAAAGCAGGUCAUAGUGAUCCGGUGGUUCUGAAUGGAAGGGCCAUCGCUCAACGGAUAAAAGGUACUCCGGGGAUAACAGGCUGAUACCGCCCAAGAGUUCAUAUCGACGGCGGUGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCACAUCCUGGGGCUGAAGUAGGUCCCAAGGGUAUGGCUGUUCGCCAUUUAAAGUGGUACGCGAGCUGGGUUUAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCUGCCGUGGGCGCUGGAGAACUGAGGGGGGCUGCUCCUAGUACGAGAGGACCGGAGUGGACGCAUCACUGGUGUUCGGGUUGUCAUGCCAAUGGCACUGCCCGGUAGCUAAAUGCGGAAGAGAUAAGUGCUGAAAGCAUCUAAGCACGAAACUUGCCCCGAGAUGAGUUCUCCCUGACCCUUUAAGGGUCCUGAAGGAACGUUGAAGACGACGACGUUGAUAGGCCGGGUGUGUAAGCGCAGCGAUGCGUUGAGCUAACCGGUACUAAUGAACCGUGAGGCUUAACCU
((((((((......(.((((((((.....(((..((((((((.((((......((((((.[..[[[.))).....((((((...(((]]]..].))).......))))))...)))....(((....)))((((((......)))))).(((((((((.........))))))))).))...((((((...................))))).).........((....))...(((((.....((.....))....)))))...((((.((((......(((((((((((((.(((...(((((......)))))[[(...).(((.....]])))...)))...)))))))))))))...))))...)....(((((((...........)))))))......(((((..[[[[)))))..)))......))..)))))).))...............((....))....))......(..((((.....))))............)).....)))))))).).....(.((((..(((((......)))))..)))).[.(.(........).).((((((....(((((((((((((..(((...((.....))...)))...((....))..((((.....)))).....)))))))))))))..((.(...((((((.....((((((((((.((((...((((((......))))))...).)))...(((.(((((........))))))))..).))))))))).(.(((.....)))...)..))))))......).))..((((((....(((((....)))))..(((((((..((((((((.(.(...(((...(((.((((...((((((.------)))).))...)))).)))..)).)...).).)))).)))..)))))))).....((((((((((......))))))))))....(.(......).)....(((.(((...((([[[...(.(((((......(.....((..(((((..(((.....{.(((....((..(((.........)))..))......(..(((......))))...)))...)))..))))).))...........]]].)....)))))))))...)))))).(((((((((....)))))))))....))))))(.((.((...((.......((((((((....))))))))....))..)).))..).....))))))(......((.....((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....[[(((.((....(((...(((....)))...)))....))..(((((........)))))]](((((((((((((...((((....((((..(((..((((((((((((...{{{.).))))))((..((((...((((((((((((.(.......)))))))))..))))..[))))...))(..(((((....)))))...))))))...)))...))))(..).....))))...))....))))))))))).)))..)).....((......)).)))).((((.....))))..))))..((((....((((((((.((..(....(.......(((((....(.{..).....)))))((((((.....(((...(((((..)]))))...)))...))))))(...).......(((((((((...((.........))...(((((((.....(((....))).......))))))).}((((.(((..((((.((..(((...(....(((((..(......)...))))).....)..))))).))..)))))(((((.........)))))........((..........((((((.....))))))..)..)....))))...)).))))))).)..))).)))))))).)))))).....))....(((((.....]..)))))..((((((((.(((.((......((.(.((((((..(((((.(((.(((((.(((((((((((.((((.(----------------------...(((((((......)))))))..---------------------).)))).)))))))))))...(((.(((.((.....)).))))))....))))).)))..)))))..(((.......))).((((.............))))..[((...(((((((...((((((.......)))))).....((][.[[[))....)))))))...((((..((((..{.))))..)))).(((....))).))]]].].....(((((((.((..]]]]..)))))))))......}......))))..))).))......(((((.(.((((((...((.......))...))))))...)))).).).....((((..((((((..(((((((.(......).))))..))).(((((.....))))).....)))))..)....)).))....(((((((....))).))))....))..)))))))))))[...(((((((...((((....(((((.....(....)....)))))...(((((...((((...(((((((((((}}}.))))))..)))))...)))).)))))...(((....((((.....}.......))))....))).))))..]....)))))))(.((((((..).)))))(....((..(((((.......)))))....((((((((..((....(((((....)))))...))...))))).))).....))..).))))))))).
>strand_B
GCCUGGCGGCCGUAGCGCGGUGGUCCCACCUGACCCCAUGCCGAACUCAGAAGUGAAACGCCGUAGCGCCGAUGGUAGUGUGGGGUCUCCCCAUGCGAGAGUAGGGAACUGCCAGGCA
(((((((((.....((((((((....(((((((...(.....)...))))..)))...)))))).)).((.......((((((((...)))))))).......))...))))))))).