Search
Structural elements
Secondary structures
Help
About
References
Links
You are
4275287
visitor.
Currently
11
users online.
Supported by:
Institute of Computing Science
,
Poznan University of Technology
Institute of Bioorganic Chemistry
,
Polish Academy of Sciences
Sequence & secondary structure in dot-bracket notation
PDB id
NDB id
Strands
Number of models
Functional class
Experimental method
Resolution [Å]
PDB deposition
3IZ9
A, C, B
1
RIBOSOME
Electron Microscopy
5.5
2010-10-04
model 1
>strand_A
GCGCGACCCCAGGUCAGGCGGGACUACCGCUGAGUUUAAGCAUAUAAAUAAGCGGAGGAGAAGAAACUUACAAGGAUUCCCCUAGUAACGGCGAGCGAACCGGGAGCAGCCCAGCUUGUCGGGCGGCUGUGCCGUCCGAGAGGCGUCCUCAGCGACGGACCGGGCCCAAGUCCCCUGGAAAGGGGCGCCUGGGAGGGUGAGAGCCCCGUCCGGCCCGGACCCUGUCGCCCCACGAGGCGCCGUCAACGAGUCGGGUUGUUUGGGAAUGCAGCCCAAAUCGGGCGGUAGACUCCGUCCAAGGCUAAAUACAGGCGAGAGACCGAUAGCGAACAAGUACCGCGAGGGAAAGAUGAAAAGGACUUUGAAAAGAGAGUCAAAGAGUGCUUGAAAUUGCCGGGAGGGAAGCGGAUGGGGGCCGGCGCGCCCCGGCCGUAUGCGGAACGGCUCUUGCUGGUCCGCCGCUCGGCUCGGGGCGUUGUUGUCGGCCGCGCCGGCGGCCAAAGCCCGGGGGCUCCGCGCCCCCGGCAGCCGUCGUCGGCACGGCCGGGCGCGCCGAAAGGCGUGCCCCUCGGGGCACUGCGCCAACGGGCUCCCCAUCCGACCCGUCUUGAAACACGGACCAAGGAGUCUGACAUGCGUGCGAGUCGACGGGUUCUGAAACCUGGGAUGCGCAAGGAAGCUGACGAGCGGGAGGCCCUCACGGGCCGCACCGCUGGCCGACCCUGAUCUUCUGUGAAGGGUUCGAGUUGGAGCACGCCUGUCGGGACCCGAAAGAUGGUGAACUAUGCCUGAGCGGGGCGAAGCCAGAGGAAACUCUGGUGGAGGCUCGAAGCGAUACUGACGUGCAAAUCGUUCGUCUGACUUGGGUAUAGGGGCGAAAGACUAAUCGAACCAUCUAGUAGCUGGUUCCCUCCGAAGUUUCCCUCAGGAUAGCUGGAGCCCCGAGUUCUAUCAGGUAAAGCCAAUGAUUAGAGGCAUUGGGGACGUCCUCGACCUAUUCUCAAACUUUAAAUAGGUAGGGGCGCGGCUGCUUCGGUGAGCCGUGCCAUCGGGUGCUCCAAGUGGGCCAUUUUUGGUAAGCAGAACUGGCGAUGCGGGAUGAACCGGAAGCCGGGUUACGGUGCCCAACUGCGCGCUAACCUAGAACCCACAAAGGGUGUUGGUCGAUUAAGACAGCAGGACGGUGGUCAUGGAAGUCGAAAUCCGCUAAGGAGUGUGUAACAACUCACCUGCCGAAUCAACUAGCCCCGAAAAUGGAUGGCGCUGAAGCGCGCGACCCACACCCGGCCAUCUGGGCGCCCCGAUGAGUAGGAGGGCGCGGCGGCCGAUGCAAAACCCGGGGCGCGAGCCCGGGCGGAGCGGCCGUCGGUGCAGAUCUUGGUGGUAGUAGCAAAUAUUCAAAUGAGAACUUUGAAGGCCGAAGAGGAGAAAGGUUCCAUGUGAACGGCACUUGCACAUGGGUAAGCCGAUCCUAAGGGAAGGGGUAACCCCGGCGCGAUCACGCGCAUCCCCGAAAGGGAAUCGGGUUAAGAUUUCCCGAGCCGGGAUGUGGCGGUUGACGGCGACGUGAAGUCCGGAGACGCCGGCGGGgGCCUCGGGAAGAGUUAUCUUUUCUGCUUAACGGCCUGCCAACCCUGGAAACGGUUCAGCCGGAGGUAGGGUCCAGUGGCCGGAAGAGCACACGUCGCGCGGUGUCCGGUGCGCCCCCGGCGGCCCAUGAAAAUCCGGAGGACCGAGUACCGUuCACGCCCGGUCGUACUCAUAACCGCAUCAGGUCUCCAAGGUGAACAGCCUCUGGCCAAUGGAACAAUGUAGGCAAGGGAAGUCGGCAAAACGGAUCCGUAACUUCGGGAAAAGGAUUGGCUCUGAGGACUGGGCUCGGGGGUCCCGGCCCCGAACCCGUCGGCUGUCGGCGGAUUGCUCGAGCUGCUCACGCGGCGAGAGCGGGUCGCCGCGUGCCGGCCGGGGGACGGACCGGGAGCCCCUUCGGGGGCUCCCCGAGCACAGUCGACUCAGAACUGGUACGGACAAGGGGAAUCCGACUGUUUAAUUAAAACAAAGCAUUGCGAUGGUCCUCGCGGAUGCUGACGCAAUGUGUgAUUUCUGCCCAGUGCUCUGAAUGUCAAAGUGAAGAAAUUCAACCAAGCGCGGGUAAACGGCGGGAGUAACUAUGACUCUCUUAAGGUAGCCAAAUGCCUCGUCAUCUAAUUAGUGACGCGCAUGAAUGAAUGGAUUAACGAGAUUCCCACUGUCCCUGUCUACUAUCCAGCGAAACCACAGCCAAGGGAACGGGCUUGGCGGAAUCAGCGGGGAAAGAAGACCCUGUUGAGCUUGACUCUAGUCCGACUUUGUGAAAUGACUUGAGAGGUGUAGGAUAAGUGGGAGCCCUCACGGGCGCAAGUGAAAUACCACUACUUUUAACGUUAUUUUACUUAUUCCGCGGAAGCGGGGCAUGCCCCUCCUUUUGGCUCCAAGGCCCGGUCUUACCGGGCCGAUCCGCGGAAGACAUUGUCAGGUGGGGAGUUUGGCUGGGGCGGCCAAUCUGUUAAAAGAUAACGCAGGUGUCCUAAGAUGAGCUCAACGAGAACAGAAAUCUCGUGUGGAACAAAAGGGUAAAAGCUCGUUUGAUUCUGAUUUCCAGUACGAAUACGAACCGUGAAAGCGUGGCCUAUCGAUCCUUUAGACUUCGGAGUUUGAAGCUAGAGGUGUCAGAAAAGUUACCACAGGGAUUACUGGCUUGUGGCAGCCAAGCGUUCAUAGCGACGUUGCUUUUUGAUCCUUCGAUGUCGGCUCUUCCUAUCAUUGCGAAGCAGAAUUCACCAAGUGUUGGAUUGUUCACCCACCAAUAGGGAACGUGAGCUGGGUUUAGACCGUCGUGAGACAGGUUAGUUUUACCCUACUGAUGACAGUGUCGCGAUAGUAAUUCAACCUAGUACGAGAGGAACCGUUGAUUCACACAAUUGGUCAUCGCGCUUGGUUGAAAAGCCAGUGGCGCGAAGCUACCGUGUGCCGGAUUAUGACUGAACGCCUCUAAGUCAGAAUCCAAGCUAGCAUGCGACGCCGCCCGCCGCCCGCCCCCAGAGGCCCGUGCCAUUGGCGCCGGUCCGGCCGAAGUGCCGCGGUCGGCCCAACGGGCGGUGGGAAUCCUUUGCAGACGACUUAAAUACGCGACGGGGCAUUGUAAGUGGCAGAGUGGCCUUGCUGCCACGAUCCACUGAGAUCCAGUCCCCGCGUCGCACGGAUUCGU
.((.(((((((((.((((((.((...(((((.....(...[..)......))).).).........((....))...((((.......(.]...)......))))...((((.-----(((((((((...))))))))).(((((.((((.(((((((.(((((((...({((((......)))))[[......(((....}]])))....)))))))...))))))).....)))))))).)....)....(((((((........))))))).....(((((..[[..[.)))))..)))..........((((((.((...............((....))....((......(..((((....))))............)(.....((((((((((.......((((((((((...((((((((((((..((((((.((((....)))).)))).))..)))).))))))))((((((.(((((.(((((((((.......(((((((.....)))))))......))))))))).))))).)(((((((....)))((((((....)))))).)))))))))))).))))))).....(((........))).((((((....((((((.((((((..((...((((((....))))))....))...(......)..(.((((.(.(.(((....))).).)..)))).).(((((((...(....)...)))).))).......)))))).))))))..((.(...((((((.....(((((((((..((((...(((((((....)))))))...).)))...(((..((.((........)))).)))....))))))))).(.((.......))...)..))))))......).))..((((((....(.((......)).)(.((((((..(((..((((((...(((((....(((..(.(((..(((((((..)))))))))).)..)))..)))))....))))))(((((((((((....)).))))))))).))..).))))))..)..((((.(((((.....))))).))))....(((......)))...(((((((...((([[[...(.((((((..................(((.((((((.(((.......(((((.(((...((.........))...))).....(....(......)..).)))))...))).)))))))))..........]]]......))))))))))...)))))))((((.(((()))).))))....))))))(.(((((((.-.(......(((-((((....)))))))....)..)))))))..).....))))))((......(.....((((((.......))))))(((((....((((..((..(((((((...((.....)).))))))....[[((((((...(((...(((....))).(((((....)))))...)))....)))..(((((........-)))))]]((((-((((.((((.((((....)))(...((.(((...((((.(((.(.(.(((((.((((...{.{.)))).)((..(.(.(.(......((.....(((.....)))......)-).....).).).)...))(((.((.....))))).)))).)...).))).))))(...)....))).))...))....))))-.)))))))).))).))).....((......)).))))..(((.....))))..))))..((((.....(((((((.((..(....(.......(((((....(.[..).....)))))(..(((((((((((.(((((((((((((((..(((..(((((((((((.((((((.((((((..(((((....)))))..)))))).)))))))).))))))..)))..))).))))))(((((....)))))))))))))).)))))..))))))..)(...).......(((((((((...((.........))...(((((((.....((......)).......)))))))--.].(((.(((..(((((..(..(((.....((((....)))).....)))).)))..)))))(((((.........)))))........((.(......).(((((.......)))))..)..)....))).----...)).))))))).)..))).)))))))..))))).....)).[..(((((.......])))))....(((((..(((.((......((((.((((((..(((((.(((.(((...(((((((((.(((((((.......[..((((...(((......)))..........]..)))).)))))))..)))))))))...(((((((((....((......)).-------------..((((((((...))))))))..)))))))))......))).)))..)))))...((......[))..((((((..........]))))))([((...(((((((.(.((((((.......))))))...).((][.[[[))....)))))))...(((..((((.......))))..))).(((....))).))]]].]...(.(((((..((((.]..]].)))).))))))...).....))))..)))))).......((.(.(.((((((...((.......))...))))))...)).).).......(((((.((((....(((.(.((........)).)...)))..((.(.....).))........)))..)...))).))....(((((((....))).))))....))..))).)))))....((((((...((((.(.(((((......(....).....))))).)(((((...((((...(((((-(((((}.}.)))))...)))))..))))..)))))..((....((((.............))))....))..)))).....))))))...((((((((((....(...)..(((......))).(((((((((((......)))).)))))))....))))))))))-((((.(..(.......)..).....((((((((.-.((....((((.(..(((((......)))))..)))))...)).------.)).))))))...))))...
>strand_C
GGAUGCGAUCAUACCAGCACUAAGGCAUCGGAUCCCGUCAGAACUCCGAAGUUAAGCGUGCUUGGGCGAGAGUAGUACAAGGAUGGGUGACCUCUUGGGAAGUCCUCGUGUUGCAUUCCC
((.((((((....((((((((.....((((((...(....)...))))..))...).))))).)).((((.((....(.((((.((....)))))).)...)).)))).)))))).))..
>strand_B
CACACGACUCUCGGCAACGGAUAUCUCGGCUCUCGCAUCGAUGAAGAACGUAGCGAAAUGCGAUACCUGGCCCGUGAACCAUCGAGUCUUUGAACGCAAGUUGCGCCCGAGGCCACUCGGGCGAGGGCACGCCUGCCUGGGCGUCACGC
-----..)))))))))).....)))..))))))))..))......((((((........))).....(.(...........)..)...)))....(((...)))((((..(.((....)).)..)))).)))))))))))).))).)).
