You are 4275274 visitor.
Currently 13 users online.


Sequence & secondary structure in dot-bracket notation
       
 PDB id   NDB id  Strands     Number of models     Functional class     Experimental method     Resolution [Å]     PDB deposition
3PYT NA0932 A, B1RIBOSOMEX-Ray Difraction3.42010-12-13


model 1
>strand_A
aGAUGGUAAGGGCCCACGGUGGAUGCCUCGGCACCCGAGCCGAUGAAGGACGUgGCUACCUGCGAUAAGCCAGGGGGAGCCGGUAGCGGGCGUGGAUCCCUGGAUGUCCGAAUGGGGGAACCCGGCCGGCGGGAACGCCGGUCACCGCGCUUUUUGCGCGGGGGGAACCUGGGGAACUGAAACAUCUCAGUACCCAGAGGAGAGGAAAGAGAAAUCGACUCCCUGAGUAGCGGCGAGCGAAAGGGGACCAGCCUAAACCGUCCGGCUUGUCCGGGCGGGGUCGUGGGGCCCUCGGACACCGAAUCCCCAGCCUAGCCGAAGCUGUUGGGAAGCAGCGCCAGAGAGGGUGAAAGCCCCGUAGGCGAAAGGUGGGGGGAUAGGUGAGGGUACCCGAGUACCCCGUGGUUCGUGGAGCCAUGGGGGAAUCUGGGCGGACCACCGCCUAAGGCUAAGUACUCCGGGUGACCGAUAGCGCACCAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGAACCCCGGGAGGGGAGUGAAAUAGAGCCUGAAACCGUGGGCUUACAAGCAGUCACGGCCCCGCAAGGGGUUGUGGCGUGCCUAUUGAAGCAUGAGCCGGCGACUCACGGUCGUGGGCGAGCUUAAGCCGUUGAGGCGGAGGCGUAGGGAAACCGAGUCCGAACAGGGCGUCUAGUCCGCGGCCGUGGACCCGAAACCGGGCGAGCUAGCCCUGGCCAGGGUGAAGCUGGGGUGAGACCCAGUGGAGGCCCGAACCGGUGGGGGAUGCAAACCCCUCGGAUGAGCUGGGGCUAGGAGUGAAAAGCUAACCGAGCCCGGAGAUAGCUGGUUCUCCCCGAAAUGACUUUAGGGUCAGCCUCAGGCGCUGACUGGGGCCUGUAGAGCACUGAUAGGGCUAGGGGGCCCACCAGCCUACCAAACCCUGUCAAACUCCGAAGGGUCCCAGGUGGAGCCUGGGAGUGAGGGCGCGAGCGAUAACGUCCGCGUCCGAGCGCGGGAACAACCGAGACCGCCAGCUAAGGCCCCCAAGUCUGGGCUAAGUGGUAAAGGAUGUGGCGCCGCGAAGACAGCCAGGAGGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCCUUUAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUGGUCGAGUGGCGCCGCGCCGAAAAUGAUCGGGGCUUAAGCCCAGCGCCGAAGCUGCGGGUCUGGGGGAUGACCCCAGGCGGUAGGGGAGCGUUCCCGAUGCCGAUGAAGGCCGACCCGCGAGGGCGGCUGGAGGUAAGGGAAGUGCGAAUGCCGGCAUGAGUAACGAUAAAGAGGGUGAGAAUCCCUCUCGCCGUAAGCCCAAGGGUUCCUACGCAAUGGUCGUCAGCGUAGGGUUAGGCGGGACCUAAGGUGAAGCCGAAAGGCGUAGCCGAAGGGCAGCCGGUUAAUAUUCCGGCCCUUCCCGCAGGUGCGAUGGGGGGACGCUCUAGGCUAGGGGGACCGGAGCCAUGGACGAGCCCGGCCAGAAGCGCAGGGUGGGAGGUAGGCAAAUCCGCCUCCCAAAAGCUCUGCGUGGUGGGGAAGCCCGUACGGGUGACAACCCCCCGAAGCCAGGGAGCCAAGAAAAGCCUCUAAGCACAACCUGCGGGAACCCGUACCGCAAACCGACACAGGUGGGCGGGUGCAAGAGCACUCAGGCGCGCGGGAGAACCCUCGCCAAGGAACUCUGCAAGUUGGCCCCGUAACUUCGGGAGAAGGGGUGCUCCCUGGGGUGAUGAGCUCCGGGGAGCCGCAGUGAACAGGCUCUGGCGACUGUUUACCAAAAACACAGCUCUCUGCGAACUCGUAAGAGGAGGUAUAGGGAGCGACGCUUGCCCGGUGCCGGAAGGUCAAGGGGAGGGGUGCAAGCCCCGAACCGAAGCCCCGGUGAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAAAGCGUAACGACCGGAGCGCUGUCUCGGCGAGGGACCCGGUGAAAUUGAACUGGCCGUGAAGAUGCGGCCUACCCGUGGCAGGACGAAAAGACCCCGUGGAGCUUUACUGCAGCCUGGUGUUGGCUCUUGGUCGCGCCUGCGUAGGAUAGGUGGGAGCCUGUGAACCCCCGCCUCCGGGUGGGGGGGAGGCGCCGGUGAAAUACCACCCUGGCGCGGCUGGGGGCCUAACCCUCGGAUGGGGGGACAGCGCUUGGCGGGCAGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCUAAAAGGUAACGGAGGCGCCCAAAGGUCCCCUCAGGCGGGACGGAAAUCCGCCGGAGAGCGCAAGGGUAGAAGGGGGCCUGACUGCGAGCCUGCAAGCCGAGCAGGGGCGAAAGCCGGGCCUAGUGAACCGGUGGUCCCGUGUGGAAGGGCCAUCGAUCAACGGAUAAAAGUUACCCCGGGGAUAACAGGCUGAUCUCCCCCGAGCGUCCACAGCGGCGGGGAGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCGUCGCAUCCUGGGGCUGAAGAAGGUCCCAAGGGUUGGGCUGUUCGCCCAUUAAAGCGGCACGCGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCUCUAUCCGCCACGGGCGCAGGAGGCUUGAGGGGGGCUCUUCCUAGUACGAGAGGACCGGAAGGGACGCACCUCUGGUUUCCCAGCUGUCCCUCCAGGGGCAUAAGCUGGGUAGCCAUGUGCGGAAGGGAUAACCGCUGAAAGCAUCUAAGCGGGAAGCCCGCCCCAAGAUGAGGCCUCCCACGGCGUCAAGCCGGUAAGGACCCGGGAAGACUACCCGGUGGAUGGGCCGGGGGUGUAAGCGCCGCGAGGCGUUGAGCCGACCGGUCCCAAUCGUCCGAGGUCU
.((......((((((((((.....(((..(((((((.((((......((((((.[[..[[.))).....((((((...(((]]..]].)))......))))))...)))....(((....)))((((((.(....).)))))).((((((.....)))))).))...((((((.....(...[..)......))))).).........((....))...(((((.....((.]...))....)))))...((((...(((((.((.....)).)))))....[.((((((..(......(...(((((.((((.(((...(((((......)))))[[(...).(((.....]])))...)))...))))..)))))..)..)..))).))))....((((((((..{......))))))))....].(((((}.[[[[)))))..)))......))..))))).))...............((....))....))......(..((((....))))............)).....)))))))))).....(.(((((..((((....))))..))))).[.(.(........).).((((((....(((((((((((((..(((...(((.....)))...)))...((....))..((((.....)))).....)))))))))))))..((.(...((((((.....((((((((((.((((...((((((......))))))...).)))...(((..((((.......<)))).)))..).))))))))).(.(((.....)))...)..))))))......).))..((((((....(((((....)))))(((((((((.(...(((((((((...(((...(((.((((.(.(((((........))).)))..)))).)))..)).)...)))))))))..)..))))))).))..((((((..((......))..)))))).....(.(......).)...(((..(((...((([[[...(.((((((.....(.....((..((((((((((.........(((.-----------------------------------------------))).....)))))))))).))..........]]].)....))))))))))...))).)))((((((((.....))))))))....))))))(.(((((...(((......(((((.(((....))))))))...)))..)))))..).....))))))(......((.....((((((.......))))))((((....((((..((..(((((((...((.....)).))))))....[[((((.(....(((...(((....)))...)))....)...(((((........)))))]](((((((((((((...((((....(((((.(((..(.(((.((((.((...{{....))))))((.(..((..(((.(((((..(.((.....)))..))))....).)))..))..)))....((........))......))).)...)))..)))))(..).....))))...))...))))))))))))))).))).....((......)).)))).(((((....)))))..))))..((((....((((((((.((..(....(.......(((((....(.[..).....)))))((((((((.(((.....))).))))))))(...).......(((((((((...((.........))...(((((((.....(((....))).......))))))).]((((.(((..(((((((..(((...((...(((((....)))))...))...))))))))..)))))(((((.........)))))........((..........((((((.....))))))..)..)....))))...)).))))))).)..))).)))))))).)))))).....))....(((((.....]..)))))..((((((((.(((..(......((((.((((((..(((((.(((.(((((.(((((..(((((((((------------------------------------------------------------------------)))))))))..)))))...(((((....)))))....))))).)))..)))))..(((......[)))((((((..........]))))))([((...(((((((.(.((.(.(.......).).))...).((]..[[[))....)))))))...((((..((...{..))...)))).(((....))).))]]].......((((((..((..]]]]..)).)))))).....)}......))))..))))))......(((((.((((((((...((.......))...)))))))..)))).).)......((((.((((((..(((((((((......))))))..))).(((((.....))))).....)))))..)...))).).....(((((((....))).))))..>.)...)))))))))))[...(((((((...((((..(((((((.....(....)....))))))).(((.(...(.((...(((((((((((.}}.))))))...)))))...)).).).)))...(((....((((.............))))....))).))))..]....)))))))...(.........).....(((((((((.......)))))....((((((((..((....(((((....)))))...))...))))).)))...))))....)).
>strand_B
uCCCCCGUGCCCAUAGCGGCGUGGAACCACCCGUUCCCAUUCCGAACACGGAAGUGAAACGCGCCAGCGCCGAUGGUACUGGGCGGGCGACCGCCUGGGAGAGUAGGUCGGUGCGGGGG
..((((((((.....((((((((....(((..(....(.....)....)....)))...)))))).))(((.......((.((((.(...))))).)).......)))..)))))))).