You are 4035091 visitor.
Currently 13 users online.


Sequence & secondary structure in dot-bracket notation
       
 PDB id   NDB id  Strands     Number of models     Functional class     Experimental method     Resolution [Å]     PDB deposition
3UOS NA1462 A, B1RIBOSOMEX-Ray Difraction3.72011-11-17


model 1
>strand_A
gGUUAAGCGACUAAGCGUACACGGUGGAUGCCCUGGCAGUCAGAGGCGAUGAAGGACGUGCUAAUCUGCGAUAAGCGUCGGUAAGGUGAUAUGAACCGUUAUAACCGGCGAUUUCCGAAUGGGGAAACCCAGUGUGUUUCGACACACUAUCAUUAACUGAAUCCAUAGGUUAAUGAGGCGAACCGGGGGAACUGAAACAUCUAAGUACCCCGAGGAAAAGAAAUCAACCGAGAUUCCCCCAGUAGCGGCGAGCGAACGGGGAGCAGCCCAGAGCCUGAAUCAGUGUGUGUGUUAGUGGAAGCGUCUGGAAAGGCGCGCGAUACAGGGUGACAGCCCCGUACACAAAAAUGCACAUGCUGUGAGCUCGAUGAGUAGGGCGGGACACGUGGUAUCCUGUCUGAAUAUGGGGGGACCAUCCUCCAAGGCUAAAUACUCCUGACUGACCGAUAGUGAACCAGUACCGUGAGGGAAAGGCGAAAAGAACCCCGGCGAGGGGAGUGAAAAAGAACCUGAAACCGUGUACGUACAAGCAGUGGGAGCACGCUUAGGCGUGUGACUGCGUACCUUUUGUAUAAUGGGUCAGCGACUUAUAUUCUGUAGCAAGGUUAACCGAAUAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGUCUUAACUGGGCGUUAAGUUGCAGGGUAUAGACCCGAAACCCGGUGAUCUAGCCAUGGGCAGGUUGAAGGUUGGGUAACACUAACUGGAGGACCGAACCGACUAAUGUUGAAAAAUUAGCGGAUGACUUGUGGCUGGGGGUGAAAGGCCAAUCAAACCGGGAGAUAGCUGGUUCUCCCCGAAAGCUAUUUAGGUAGCGCCUCGUGAAUUCAUCUCCGGGGGUAGAGCACUGUUUCGGCAAGGGGGUCAUCCCGACUUACCAACCCGAUGCAAACUGCGAAUACCGGAGAAUGUUAUCACGGGAGACACACGGCGGGUGCUAACGUCCGUCGUGAAGAGGGAAACAACCCAGACCGCCAGCUAAGGUCCCAAAGUCAUGGUUAAGUGGGAAACGAUGUGGGAAGGCCCAGACAGCCAGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAAAGCGUAAUAGCUCACUGGUCGAGUCGGCCUGCGCGGAAGAUGUAACGGGGCUAAACCAUGCACCGAAGCUGCGGCAGCGACGCUUAUGCGUUGUUGGGUAGGGGAGCGUUCUGUAAGCCUGCGAAGGUGUGCUGUGAGGCAUGCUGGAGGUAUCAGAAGUGCGAAUGCUGACAUAAGUAACGAUAAAGCGGGUGAAAAGCCCGCUCGCCGGAAGACCAAGGGUUCCUGUCCAACGUUAAUCGGGGCAGGGUGAGUCGACCCCUAAGGCGAGGCCGAAAGGCGUAGUCGAUGGGAAACAGGUUAAUAUUCCUGUACUUGGUGUUACUGCGAAGGGGGGACGGAGAAGGCUAUGUUGGCCGGGCGACGGUUGUCCCGGUUUAAGCGUGUAGGCUGGUUUUCCAGGCAAAUCCGGAAAAUCAAGGCUGAGGCGUGAUGACGAGGCACUACGGUGCUGAAGCAACAAAUGCCCUGCUUCCAGGAAAAGCCUCUAAGCAUCAGGUAACAUCAAAUCGUACCCCAAACCGACACAGGUGGUCAGGUAGAGAAUACCAAGGCGCUUGAGAGAACUCGGGUGAAGGAACUAGGCAAAAUGGUGCCGUAACUUCGGGAGAAGGCACGCUGAUAUGUAGGUGAGGUCCCUCGCGGAUGGAGCUGAAAUCAGUCGAAGAUACCAGCUGGCUGCAACUGUUUAUUAAAAACACAGCACUGUGCAAACACGAAAGUGGACGUAUACGGUGUGACGCCUGCCCGGUGCCGGAAGGUUAAUUGAUGGGGUUAGCGCAAGCGAAGCUCUUGAUCGAAGCCCCGGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAUGGCGUAAUGAUGGCCAGGCUGUCUCCACCCGAGACUCAGUGAAAUUGAACUCGCUGUGAAGAUGCAGUGUACCCGCGGCAAGACGGAAAGACCCCGUGAACCUUUACUAUAGCUUGACACUGAACAUUGAGCCUUGAUGUGUAGGAUAGGUGGGAGGCUUUGAAGUGUGGACGCCAGUCUGCAUGGAGCCGACCUUGAAAUACCACCCUUUAAUGUUUGAUGUUCUAACGUUGACCCGUAAUCCGGGUUGCGGACAGUGUCUGGUGGGUAGUUUGACUGGGGCGGUCUCCUCCUAAAGAGUAACGGAGGAGCACGAAGGUUGGCUAAUCCUGGUCGGACAUCAGGAGGUUAGUGCAAUGGCAUAAGCCAGCUUGACUGCGAGCGUGACGGCGCGAGCAGGUGCGAAAGCAGGUCAUAGUGAUCCGGUGGUUCUGAAUGGAAGGGCCAUCGCUCAACGGAUAAAAGGUACUCCGGGGAUAACAGGCUGAUACCGCCCAAGAGUUCAUAUCGACGGCGGUGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCACAUCCUGGGGCUGAAGUAGGUCCCAAGGGUAUGGCUGUUCGCCAUUUAAAGUGGUACGCGAGCUGGGUUUAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCUGCCGUGGGCGCUGGAGAACUGAGGGGGGCUGCUCCUAGUACGAGAGGACCGGAGUGGACGCAUCACUGGUGUUCGGGUUGUCAUGCCAAUGGCACUGCCCGGUAGCUAAAUGCGGAAGAGAUAAGUGCUGAAAGCAUCUAAGCACGAAACUUGCCCCGAGAUGAGUUCUCCCUGACCCUUUAAGGGUCCUGAAGGAACGUUGAAGACGACGACGUUGAUAGGCCGGGUGUGUAAGCGCAGCGAUGCGUUGAGCUAACCGGUACUAAUGAACCGUGAGGCUUAACCU
.(((((((......((((((((((.....(((..(((((((((..((......((((((.[..[[[.)))....(((((((...(((]]]..].))).......)))))).).)))....(((....)))((((((......)))))).(((((((((.........))))))))).))...((((((.........[.........))))).).........((....))...(((((.....((.]...))....)))))...((((.((.(......(((((.(((((((.(((...(((((......)))))[[(...).(((.....]])))...)))...))))))).)))))...).))...)....((((((((..[......))))))))......(((((].[[[[)))))..))).........))))))).))...............((....))....))......(..((((.....))))............)).....)))))))))).....(.((((..(((((......)))))..)))).[.(.(........).).((((((....(((((((((((((..(((...((.....))...)))...((....))..((((.....)))).....)))))))))))))..((.(...((((((.....((((((((((.((((...((((((......))))))...).)))...(((.(((((........))))))))..).))))))))).(.(((.....)))...)..))))))......).))..((((((....(((((....)))))..(((((((..((((((((((.(...(((...(((.((((.....(.(..-------).)......)))).)))..)).)...).)))))).)))..)))))))).....((((((((((......))))))))))....(((......)))...((((.(((...((([[[...(.((((((.....(.....((..(((((..(((.....{.(.((..(......(.........)......).....(..(((......))))..)).)...)))..))))).))...........]]].)...))))))))))...)))))))(((((............)))))....))))))(.(((((...(((......((((((((....))))))))...)))..)))))..).....))))))(......((.....((((((.......))))))((((....((((..((..(((((((...((.....)).))))))....[[(((.((....(((...(((....)))...)))....))..(((((........)))))]]((((((((((((....((((....((((..(((..((((((((((((...{{{.).))))))((..((((...(((.((((((((.(.......)))))))))...)))..[))))...))(..(((((....)))))...))))))...)))...))))(..).....))))....)....))))))))))).))).))).....((......)).)))).((((.....))))..))))..((((....((((((((.((..(....(.......(((((....(.{..).....)))))((((((.....(((...(.(.(..)].).)...)))...))))))(...).......(((((((((...((.........))...(((((((.....(((....))).......))))))).}((((.(((..(((((((..(((........(((((.............)))))........))))))))..)))))((.((.........)).))........((..........((((((.....))))))..)..)....))))...)).))))))).)..))).)))))))).)))))).....)).{..(((((.....]}.)))))..((((((((.(((.((......((((.((((((..(((((.(((.(((((.(((((((((((..(...(----------------------...((.(............).))..---------------------)...)..)))))))))))...(((.((((((.....)))))))))....))))).)))..)))))..(((......[)))(((((...........].)))))([((...((((((....((((((.......)))))).....((][.[[[)).....))))))...((((..((((..{.))))..)))).(((....))).))]]].].....(((((((.((..]]]]..))))))))).....)}......))))..))))))......(((((.(.((((((...((.......))...))))))...)))).).).....(((((.((((((..(((((((((......))))))..))).(((((.....))))).....)))))..)...))).))....(((((((....))).))))....))..)))))))))))[...(((((((...((((..(((((((.....(....)....))))))).(((((...((((...(((((((((((}}}.))))))..)))))...)))).)))))...(((....((((.....}.......))))....))).))))..]....)))))))(.((((((..).)))))(....((..(((((.......)))))....((((((((..((....(((((....)))))...))...))))).))).....))..).))))))))..
>strand_B
GCCUGGCGGCCGUAGCGCGGUGGUCCCACCUGACCCCAUGCCGAACUCAGAAGUGAAACGCCGUAGCGCCGAUGGUAGUGUGGGGUCUCCCCAUGCGAGAGUAGGGAACUGCCAGGCA
(((((((((.....((((((((....(((.(((...(.....)...)))...)))...)))))).)).((.......((((((((...)))))))).......))...))))))))).