You are 4034938 visitor.
Currently 8 users online.


Sequence & secondary structure in dot-bracket notation
       
 PDB id   NDB id  Strands     Number of models     Functional class     Experimental method     Resolution [Å]     PDB deposition
4A19 NA1395 11RIBOSOMEX-Ray Difraction3.522011-09-14


model 1
>strand_1
cUACACCUGAAACAAGCAAGAUUACCCGCUGAACUUAAGCAUAUCAGUAAGCGGAGGAAAAGAAACUAACUAGGAUAGCCCCAGUAAUGGCGAAUGAACAGGCUAAAGCUCAAAGUGAAAAUCUGAAGUGGUCAACACAACAGAAUUGUAAUCUAAAGGGUCAACCUGAAACUAAGCUCCUCUCAUAAGUUCCUUGGAACAGGACGUCAAAGAGGGUGACAACCCCGUAGUCGGAGAGGAAGGCUGGUGUAAGGGAGAUUUCAAAGAGUCGGGUUGUUUGGGAUUGCAGCCCUAAGUGGGAGAUAAACUUCUUCUAAAGCUAAAUAUACACGGGAGACCGAUAGCGAACAAGUACUGCGAAGGAAAGAUGAAAAGAACUUUGAAAAGAGGGCUAAAAGACUUGAAACCGUUGAGAAGGAAGCUGUAGAAGAGCAAUAAACUGGACGGCGCAUAAGGGGGAAGUACUAAUCACUGCAGAGUCGAUACGUAAAAGGUCGAUGAGUAAGGAAAUGGUACAGAACUUGCUACGCCGGUCAGAAGACAAAAUGGGUUCAGAUUGAAGGAGUCACCUGAGAUCGGGCAGCAAUGCAGAUCAAAAGGAAAACUUCAAACUGGACUGAGGGGCCUAAGGGCGAUUUUGUCAAAAUGGCUUCUACUGACCCGUCUUGAAACACGGACCAAGGAGUCUAUCAAUUAAGCGAGUGAUAGGGUGGAAAAACCCGUCCGCGAAACGAAAGUGAGUACAAGGUGCCAAGCCGCAAGGUAGCAGCAUCACCCGACCUUGAGUCUCCGACGAAGGGUUCGAGGAAGAGCUUAAUUGUUAGGACCCGAAAGAUGGUGAACUACGCUUGAAUAGGGUGAAGCCAGGGGAAACUCUGGUGGAAGCUCGUAGCGAUACUGACGUGCAAAUCGUUCGUCAAAUUUGAGUGUAGGGGCGAAAGACUAAUCGAACCAUCUAGUAGCUGGUUCCCUCCGAAGUUUCUCUCAGGAUAGCAAGAGCAAGUACGCAGUUUUAUUAGGUAAAGCGAAUGAUUAGAGGACUCGGGGUUCCAAGAAUCUCGACCUAUUCUCAAACUUUAAAUUGGUAAGAGCCGCGGAGUUUACUUAAAUGAACUCUCGGGAAGAAUGCAGUGCUCUUAGUGGGCCAUUUUUGGUAAGCAGAACUGGCGAUGAGGGAUGAACCUAACGUUGAGAUAAGGCGCCCAAAUGCACGCUCAUCAGAUACCACAAAAGGUGUUGGUUCAUACGGACAGCAGGACGGUGGCUAUGGAAGUUAGAAUCCGCUAAGGAGUGUGUAACAACUCACCUGCCGAAUGAACUAGCCCUGAAAAUGGAUGGCGCUGAAGCGUGUUGCCGAUACUCAACCAUCAGAGCAAAUGCGAGGCUUUGAUGAGUAGGAGGGCGUGAUCGUUGCCUAGAAGUAUUGGGCGUGAGCCUAUAUGGAGCAGCGAUUAGUGCAGAUCUUGGUGGUAGUAGCAAAUAUUCAAAUGAGAACUUUGAAGACCGAAGUGGAGAAGGGUUCCAUGAGAACAGCAAUUGUUCAUGGGUUACUCGAUCCUAAGACAUAGGUUAACUCCUUGCAAUACAAGAAGACAUUCGUUUUCGUUGUCAAAAGGGAAUGAGGUUAAUAUUCCUCAAGCUGGACGUGGUAUAGAGCGGUAACGCAAAGAAACCCGGAGACGUCAGCAGGUGUCACUGGAAGAGUUAUCUUUUCUUUUUAACAUACUAUGGCCAUGAAAUUGGAUUAUCCAGAGAUAUCGGCUGUAUGUAUGGCAGAGCAGCUCACCCUAAGAGCUGUCAGUUGCGCACCUGAUGACCCUUGAAAAUCUGGGGGAGACAUAAUUUCACGCCAGUUCGUACCCAUAACCGCAUCAGGUCUCCAAGGUUAGCAGCCUCUGGUCCAUAGAACAAUGUAGAUAAGGGAAGUCGGCAAAUUGGAUCCGUAACUUCGGGAUAAGGAUUGGCUCUGAGGAUCGGGUAUAAAGGCUUUGUAAUGAUAUCCAAGCUUGUUUGUUAGUGUGGCAACAUGCUGAUAGACUUGCGAACGAUGAAUUUGCAAGGUAGGUUUCGGCCGUCUUUAUACAAUUAACGAUCAACUCAGAACUGAAGCGGACAAAGGUAAUCCGACUGUUUAAUAAAAACAAAGCAUUGUGACGGCCUCAACAGGUGAUGACACAAUGUGAUUUCUGCCCAGUGCUCUGAAUGUCAAAGUGACGCAAUUCAACCAAGCGCGGGUAAACGGCGGGAGUAACUAUGACUCUCUUAAGGUAGCCAAAUGCCUCGUCAUCUAAUUAGUGACGCGCAUGAAUGGAUUAAUGAGAUUACCACUGUCCCUAUCUACUAUCUAGCGAACCCACAGCUAAGGGAACGGGCUUAGAAUAAUCAGCGGGGAAAGAAGACCCUGUUGAGCUUGACUCUAGUCUAACUUUGUGAAAUGGCACGUGGGGUAUAGCCUAGGUGGGAGAGCAAUCGAUCCUGUAAAACCACUACCCACGUAGUCAUUUUGCUUAUUUCGUGAAGAAAAGACUGGUGCAAACCAGUUCUAAAGUUAAGGUCAUUUAUUGACUGAUUUUUGCGAAAGACAUGGUUAGGGGGGGAGUUUGUCUGGGGCGGAAUGCCUGUUAAACCAUAACGCAGGCGUCCUAAGUGUAGCUCAGUGAGAACGGAAAUCUCACGUAGAACAAAAGGGUAAAAGCUACAUUGAUUUUGAUUUUCAGUAGGAAUACAAACCGCGAAAGCGUGGCCUAUCGAUCCUUUAACUUUACAAGUUUUAAGCUAGAGGUGUCAGAAAAGUUACCACAGGGAUAACUGGCUUGUGGCAGCCAAGAGUUCAUAUCGACGUUGCUUUUUGAUCCUUCGAUGUCGGCUCUUCCUAUCAUUGUGAAGCAGAAUUCACAACGUGUCGGAUUGUUCACCCGCUAAUAGGGAACGUGAGCUGGGUUUAGACCGUCGUGAGACAGGUUAGUUUUACCCUACUGAUGAAACGAUGUUGCGACAGUAAUUUAAGUUAGUACGAGAGGAACACUUAAAUCAGAUAAUUGGUAAAUACGGUUGUCUGAAAAGACAAUGCCGUGAAGCUACCAUCUGUUGGAUUAUGACUGAAGGCCUCUAAGUCAGAAUCCAUGCUGGAAAGCAAUGUCUAAGUGUGAUGAUAAACGAAAAAAAAUAAAAAUUAAGUUCGAAAGGUAGAGCGGGGAAGAGCGAAAAAGCUUGACCUUAACUGCUAAUCGUAAUUCCAAAUUAUCAUCUACGUAAAUCUUUUGUAGACGACUUAACAUGGAACGGGUAUUGUAAGCAUGAGAGUAGAAUUUCCUACGAUCUGCUGAGAUUCAGCCCGUCUCCUUAGAUUUAUCU
.........................((((......(...[..).......))))...........((....))...((((......((.]...)).....))))...((((.........(((((..(((.....)))..))))....)........(((((..(((...(((..(((((((((....({((((......)))))[[(...).(((....}]]))).......)))))))..)).)))...)))..)))).)...)....(((((((........))))))).....(((((..[[[[[[)))))..)))..................................((....))............(..((((....))))..........).....................(.(((((((.....(...((((.(((((.....(((....(((((.((..((.(...((((((.(......)))))))..)..))...)))))))....)))....))))).))))..((((((((.(((((((.((((((......(((..((((..(((....))).))))...)))....)))))).))))))).....(((....))).))))))))...)...))))))).).[((((........))))((((((....(((.(((((((((..(((...(((........)))...)))...((....))........(((((...(((....)))....))))).(((((((....(((...)))....)).))).))....))))))))).)))..((.(...((((((.....((((((((((.(((....(((((((....)))))))....[)))...(((..((.((........)))).)))..).))))))))).(.((.......))...)..))))))......).))..((((((....(.(((....))).)(((((((((.....(((.(((((((((...(((....(((..(.(((..(((((((((...)))))))))))).)..)))..)).)...)))))))...(((.((((((..(......))))))))))....)))))..))))))).))..((((.(((((.....))))).))))....(((......)))...((((((....((([[[...(.((((((......(..........(((.((((((((((.......(((((------------------------------------------------)))))...)))))))))))))..........]]].)....))))))))))....))))))(((((((((.........)))))))))....))))))(.((((((((((......((((.((((....))))))))...))))))))))..).....))))))((.....((.....((((((.......))))))((((.....((((..((..(((((((...((.....)).)))))).....[(((.((...(((..(((......)))......(...(((((......))))).).)))....))...(((((........)))))].((((.((((..((...(((....))).....<.((((((...((((.((((((((((((((((((...{{..))))))(...(((((...((((((.....(((.....))).....)).))))....)))))....)(((((((.------))))))))))).).))))))).))))(...)....)))))).........))..)))))))).))).))).....((......)).)))).((((.....))))..))))..((((.....(((((((.((..(....(.......(((((....(.{..).....)))))((.((((((...--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------)))))).))(...).......(((((((((.].((.........))...(((((((....((((....))))......))))))).}.(((.(((..((((((.(...((.....(((......))).....)).)))))..)))))((((((.......))))))........((..........(((((.......)))))..)..)....)))....)).))))))).)..))).)))))))..))))))....)).{..(((((.....]}.)))))....(((((..(((.((......((((.((((((..(((((..(((((((...(((((((((.---------------------------------------------------------)))))))))....(((((.....((((..(((((....))))).........>..(((((.....)))))..))))..))))).....)))))))...)))))..(((......[)).)((((((..........]))))))([((...(((((((.(.((((((.......))))))...).((][.[[[))....)))))))...(((..((((....{..))))..))).(((....))).))]]].].....(((((.(.(((.]]]]]])))).)))))....)}....))))..)))))).......((.(.(.((((((...((.......))...))))))...)).).).........(((.((((((..(((((((((......))))))..))).(((.(.....).))).....)))))..)...))).......(((((((....))).))))....))..))).))))).....((((((((..((((.(((((((......(....).....)))))))(((((...((((....((((((((((}}..)))))..)))))...))))..))))).((((...((((.............))))...)))).))))....))))))))...(.((((((((....(.((................)))...(.((((...(((...((((......))))..)))...)))))..............)))))))))....((((((.(..(.......)..)....((((((((.(((....(((.((..((((......))))..)))))...)))....))))).)))...)))))).--