You are 4034895 visitor.
Currently 8 users online.


Sequence & secondary structure in dot-bracket notation
       
 PDB id   NDB id  Strands     Number of models     Functional class     Experimental method     Resolution [Å]     PDB deposition
4Y1N A, B1RNA, TRANSFERASEX-Ray Difraction32015-02-08


model 1
>strand_A
GUUAUGUGUGcCCGGCAUGGGUGCAGUCUAUAGGGUGAGAGUCCCGAACUGUGAAGGCAGAAGUAACAGUUAGCCUAACGCAAGGGUGUCCGUGGAAACAUGGAAUCUGAAGGAAGCGGACGGCAAACCUUCGGUCUGAGGAACACGAACUUCAUAUGAGGCUAGGUAUCAAUGGAUGAGUUUGCAUAACAAAACAAAGUCCUUUCUGCCAAAGUUGGUACAGAGUAAAUGAAGCAGAUUGAUGAAGGGAAAGACUGCAUUCUUACCCGGGGAUC
----------.(((({..(((((((((((...(((.......)))..(((((...[[[[[[[...)))))..(((...(((..(....((((((....))))))..).----}..)))...)))...(((((((((((.....-------((((......(((..((((((((((((..((((........))))...)))).]]]]]]]...))))))))..)))...)))).)))))---))))))...)))))))))))..--)))).....
>strand_B
GUUAUGUGUGCCCGGCAUGGGUGCAGUCUAUAGGGUGAGAGUCCCGAACUGUGAAGGCAGAAGUAACAGUUAGCCUAACGCAAGGGUGUCCGUGGAAACAUGGAAUCUGAAGGAAGCGGACGGCAAACCUUCGGUCUGAGGAACACGAACUUCAUAUGAGGCUAGGUAUCAAUGGAUGAGUUUGCAUAACAAAACAAAGUCCUUUCUGCCAAAGUUGGUACAGAGUAAAUGAAGCAGAUUGAUGAAGGGAAAGACUGCAUUCUUACCCGGGGAUC
-{{{.-----((((.{..(((((((((((...(((.......)))..(((((...[[[[[[[...)))))..(((...(((..((((-((((((....))))))))))----}..)))...)))...(((((((((((...........(((((.....[(((..((((((((((((..((((.].}}}..))))...)))).]]]]]]].-.))))))))..)))...)))))))))).--))))))...)))))))))))...--))))....